Είναι δεδομένο γεγονός, πως τα ΑΑΣ έχουν υποδοχείς στον εγκέφαλο και επηρεάζουν σε άμεσο βαθμό η χημεία του.
Το κλινικό φαινόμενο του roid rage αποτελεί γνωστή εμπειρία για όποιον καταχράστηκε τα στεροειδή, κυρίως για αγωνιστικούς σκοπούς. μελαγχολία, θλίψη, κατάθλιψη, κατατονία, υπομανία, κρίση μανίας, διπολική διαταραχή, ψυχώσεις, νευρώσεις και αϋπνία αποτελούν κλινικές εκδηλώσεις της ψυχικής σφαίρας ενός εθισμένου χρήστη αναβολικών.
Τόσο τα ανδρογόνα, όσο και τα οιστρογόνα έχουν τις επιδράσεις τους στην εγκεφαλική λειτουργία.
Τα ανδρογόνα μπορεί να αυξήσουν τη μετάδοση νευρικών συνάψεων, ενώ τα οιστρογόνα να προκαλέσουν μια κατάσταση ευφορίας, κάτι που δίνουν συγκεκριμένα αναβολικά που αρωματίζουν.
Σε μαγνητική τομογραφία χρήστη ανδρογόνων αναβολικών στεροειδών παρατηρήθηκε ότι μια συγκεκριμένη περιοχή του εγκεφάλου, όπου εδρεύει το περίφημο μεταιχμιακό σύστημα, που καθορίζει τα συναισθήματα, τα λεγόμενα «αμύγδαλα» ήταν μεγενθυμένα. Χημική ανάλυση του μεταβολισμού στο γλουταμινικό οξύ έδειξε αυξημένη κατανάλωση αυτού, κάτι που αντανακλά άμεσα στην εγκεφαλική λειτουργία. Κάτι ακόμη αξιοπρόσεκτο ήταν το γεγονός πως οι χρήστες αναβολικών παρουσίαζαν ελαττωμένη απόδοση σε ειδικά ψυχιατρικά test που αφορούσαν τη βραχυπρόθεσμη μνήμη.
Το ισχυρότερο ενέσιμο αναβολικό η τρενμπολόνη, που τυγχάνει να έχει και μεγάλη ανδρογονική ικανότητα, έπαιξε καταλυτικό ρόλο στην εκφύλιση νευρώνων του ιππόκαμπου, ο οποίος επίσης ανήκει στο μεταιχμιακό σύστημα.